南京海昌中藥集團為南京中醫藥大學與南京高新技術經濟開發總公司合作，于2008年6月，在南京國家級高新技術產業開發區內成立的，以現代中藥飲片、中成藥及其設備的研發、生產與制造為核心內容的產、學、研緊密結合的高新技術企業。公司注冊資金為1億元人民幣，是現代中藥的產、學、研聯合示范工程。集團主要研發、生產按現代規范加工炮制的中藥飲片、中成藥、中藥飲片加工炮制器械、提取分離設備等。集團擁有南京海昌中藥集團研究院以及南京海源中藥飲片有限公司、江蘇海昇藥業有限公司、杭州海善制藥設備有限公司3家子公司。